加利福尼亞大學伯克利分校(加州大學伯克利分校)的科學家們發明瞭一種按需建立DNA序列的新方法。它不需要使用有毒化學物質,並且比迄今世界各地實驗室使用的常規DNA合成技術更準確。新方法可以在夜間合成基因 – 它可以產生比人工製造的DNA鏈長十倍的DNA鏈。科學家們表示,它可能導致研究實驗室的“DNA 3D列印機”,其工作方式與許多現代化研討會中的3D列印機一樣。
加州大學伯克利分校的研究生Dan Arlow說:“如果你是一名機械工程師,在你的商店裡有一臺3D列印機真的很棒,它可以在一夜之間列印出一部分,所以你可以在第二天早上進行測試。如果你是研究人員或生物工程師,而且你有一種簡化DNA合成的工具,那麼’DNA列印機’,你可以更快地測試你的想法,並嘗試更多的新想法。”
隨著公司訂購定製基因,合成DNA是一項日益增長的業務,因此他們可以在微生物大桶中生產生物藥物,工業酶或有用的化學物質。世界各地的實驗室購買合成基因插入植物或動物或嘗試新的基於CRISPR的疾病治療。一些科學家甚至提出將資訊儲存在DNA中,因為一克DNA在理論上可以儲存相當於5000萬張DVD,而且可以穩定數百年。然而,這意味著合成的DNA鏈比目前在生物技術行業使用的DNA鏈數量大得多。
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然而,目前的DNA合成使用1981年開發的基於有機化學方法學的技術來生產長約200個鹼基的所謂寡核苷酸,因為隨著長度增加,該過程中不可避免的錯誤導致正確序列的產量低。要裝配一個小基因,科學家們必須逐段合成它,大約200個鹼基長,然後將它們縫合在一起。這種技術非常耗時,非常昂貴,而且不完全精確。
新的“DNA 3D列印機”方法基於在免疫系統的細胞中發現的DNA合成酶和TdT(脫氧核苷酸轉移酶末端),其天然能夠將核苷酸新增到水中的現有DNA分子,其中DNA是最穩定。與其他酶不同,TdT不依賴於現有的DNA模板進行複製。相反,它會將核苷酸隨機新增到製備用於免疫系統的抗體的基因中。
Ard的同事Sebastian Palluk說,TdT在加入所有四種DNA核苷酸方面效果同樣好,沒有副作用,可能會導致產生的分子結塊,而且速度非常快,每分鐘延伸DNA約200個鹼基。事實上,伯克利的研究人員在他們的第一個試驗中表明,他們更快,更簡單的技術在當前技術的每一步合成中幾乎都是精確的。
“當我們使用NGS分析產品時,我們能夠確定大約80%的分子具有期望的10鹼基序列,”Arlow說。 “這意味著,平均每個步驟的產量約為98%,我們希望達到99.9%全長DNA。一旦它們達到99.9%的保真度,他們可以一次性合成一個1000個鹼基長的分子,產率超過35%,這對於目前的化學合成技術是完全不可能的。“Palluk說。
這種新方法旨在加速多領域的研究,使生物工程人員更容易更快找出如何生物製造有用產品。它可能是合成生物學發展的一個進步,合成生物學是一個為實際目的而研究人造微生物的創造的分支。